ARCHIVAL SINGLE-CELL DNA
Arc-well
回顾性研究
从福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）组织中获取单细胞拷贝数改变（CNA）图谱，比较不同时间点的克隆结构。
Cell 2023 · 存档样本单细胞 DNA
了解技术与适用样本
START WITH THE MATERIAL从样本条件，找到研究入口。
BUILT ON PUBLISHED RESEARCH
40,330Arc-well · 论文分析单细胞33,646wellDR-seq · 论文分析单细胞研究证据可追溯
两篇论文的研究样本不同，数据不等同于当前商业交付规模。
ONE RESEARCH CONTINUUM
不是把检测堆在一起，
而是让证据逐层接上。
以“样本—工作流—洞察”为主线，把不同材料、分子层级与验证方向组织成一条可读、可讨论的研究路径。
科研概念视觉 · 非实验数据图- 01
样本与时间
从存档 FFPE、新鲜组织或已有数据出发，先明确材料条件与研究时间线。
- 02
DNA 与克隆
以单细胞 CNA 观察克隆组成、共享事件及跨时间点的变化线索。
- 03
DNA + RNA 与状态
在适合的新鲜组织中，将遗传亚克隆与同一细胞的表达状态直接对应。
- 04
空间与验证
围绕候选发现规划组织定位、队列复核或功能实验，把解释带入下一步。
并非每个项目都需要覆盖全部层级；实际技术组合、样本要求与交付范围按研究问题确认。
TWO METHODS. ONE RESEARCH CONTINUUM.
从克隆结构，
到细胞状态。
两条样本路径，保留每个细胞的遗传信息。
SAME-CELL DNA + RNA
wellDR-seq
不只知道它是谁，
还要看它处于什么状态。
在同一细胞中获得 DNA 拷贝数与 RNA 表达信息，把基因组亚克隆与转录程序直接配对。适用于经评估的新鲜组织研究。
Cell 2025 · 同细胞基因型—表型
了解技术与适用样本
FIND YOUR STARTING POINT
手里的样本类型
先从样本和问题出发，再选择技术。
WHY CLONAL RESOLUTION
把“测到了什么”与“能解释什么”分开，围绕可验证的问题组织实验和分析。
直接测量 DNA 拷贝数
单细胞 CNA 为克隆分析提供基因组依据，补充群体平均信号和基于 RNA 的推断。
保留同细胞配对
wellDR-seq 将 DNA 与 RNA 保留在同一细胞坐标中，便于比较克隆之间的转录状态。
把线索带入验证
从克隆结构到候选基因，再接空间定位、队列复核与功能实验，而不止停留在热图。
BIOINFORMATICS
生物信息分析
克隆、细胞状态与组织位置，
从不同层面解读同一个研究问题。
DNA · CLONAL STRUCTURE
比较克隆结构，追踪演化线索。
从单细胞 DNA 拷贝数图谱出发，比较亚克隆组成、共享事件和时间点之间的变化。
- CNA 图谱与亚克隆分群
- 克隆组成与共享事件
- 结合病理时间线的演化分析
RNA · CELLULAR STATES
区分细胞类型，解析群体内部差异。
以细胞类型鉴定为起点，结合标记表达、组成比较与差异分析，观察样本中的细胞状态。
- 降维分群与标记表达
- 细胞组成和异质性
- 通路富集及候选程序
SPACE · TISSUE CONTEXT
让细胞信息，回到组织的位置。
把细胞类型、区域差异和相邻关系放在组织坐标中解读，再与克隆信息讨论联合研究。
- 组织区域与细胞类型分布
- 空间异质性及邻域关系
- 匹配样本的跨数据整合
NETWORKS · CANDIDATE MECHANISMS
从状态差异，延伸到候选调控关系。
结合细胞关系、通讯和基因调控网络分析，为后续机制研究筛选值得验证的方向。
- 细胞关系与轨迹分析
- 细胞通讯图谱
- 基因调控网络与候选因子
FROM SAMPLE TO INSIGHT
取样、送样与项目流程
从取样前沟通到结果解读，让每一步都有明确安排。
查看取样与送样准备- 01
需求沟通
明确研究问题、材料条件与预期结果。
- 02
确定项目方案
确认技术路线、对照、样本规模及交付范围。
- 03
取样与寄送
按确认方案准备样本，独立编号并记录交接。
- 04
样本质检
核对样本信息，评估组织、细胞或细胞核质量。
- 05
H&E 染色与选片
病理及空间项目按需进行区域评估与选片。
- 06
正式实验
按对应技术路线完成前处理、建库与测序。
- 07
生信分析
从质量控制到克隆、表达及空间关联分析。
- 08
结果交付
交付约定数据与图表，安排结果解读。
THREE LAYERS OF SIGNAL
同一个问题，
从三个尺度看见。
从克隆结构、细胞状态到组织位置，按研究问题定位入口；每一层都对应明确的数据基础与下一步验证方向。
Wang et al., Cell 2023 · Figure 5A
图例：所提供单细胞测序资料 · 第 2 页
图例：所提供空间转录组资料 · 第 2 页图例用于说明分析层级，不代表当前项目实测结果；适用数据、分析组合及验证方式按项目确认。
LET’S BUILD YOUR STUDY
从一个明确的问题，开始合作。
带上样本类型、研究问题和现有数据，一起判断最合适的起点。