DNA · CLONAL STRUCTURE
比较克隆结构，追踪演化线索。
从单细胞 DNA 拷贝数图谱出发，比较亚克隆组成、共享事件和时间点之间的变化。
- CNA 图谱与亚克隆分群
- 克隆组成与共享事件
- 结合病理时间线的演化分析
BIOINFORMATICS & DATA INTERPRETATION
生物信息分析
从克隆结构到细胞状态，再到空间微环境，按研究问题组织数据、图表与结果解读。
BIOINFORMATICS
生物信息分析
克隆、细胞状态与组织位置，
从不同层面解读同一个研究问题。
RNA · CELLULAR STATES
区分细胞类型，解析群体内部差异。
以细胞类型鉴定为起点，结合标记表达、组成比较与差异分析，观察样本中的细胞状态。
- 降维分群与标记表达
- 细胞组成和异质性
- 通路富集及候选程序
SPACE · TISSUE CONTEXT
让细胞信息，回到组织的位置。
把细胞类型、区域差异和相邻关系放在组织坐标中解读，再与克隆信息讨论联合研究。
- 组织区域与细胞类型分布
- 空间异质性及邻域关系
- 匹配样本的跨数据整合
NETWORKS · CANDIDATE MECHANISMS
从状态差异，延伸到候选调控关系。
结合细胞关系、通讯和基因调控网络分析，为后续机制研究筛选值得验证的方向。
- 细胞关系与轨迹分析
- 细胞通讯图谱
- 基因调控网络与候选因子
ANALYSIS DELIVERABLES
数据、图表与结果解读
围绕研究问题确定分析组合，交付内容在项目方案中确认。
质量与基础结果
样本和数据质控、注释说明、基础结果表，以及对应的分析版本信息。
图表与专题分析
按约定提供克隆、表达、空间或网络分析图表，并说明各图所对应的数据与分组。
解读与后续讨论
结合研究设计解读结果，讨论补充验证、扩大队列与下一阶段分析。
PLAN YOUR ANALYSIS
从研究问题，确定分析内容。
带上样本概况、已有数据和研究目标，讨论适合的分析组合。