01基于已发表研究延伸
原发—复发配对队列
复发与原发之间，哪些克隆关系仍然存在？
- 样本起点
- 有明确时间线与病理记录的配对 FFPE。
- 重点分析
- 单细胞 CNA、亚克隆组成、共享与新增事件、候选演化模型。
查看验证与设计要点
候选 CNA 的 DNA 层面验证；独立病例复核。
RESEARCH APPLICATIONS
让技术的价值，
落到你的研究问题上。
从病理库队列到同细胞机制证据，再到空间和功能验证。为下一步实验找到清晰路径。
CHOOSE THE QUESTION, THEN THE ASSAY
按研究问题，
找到合适的切入点。
这些是应用场景与研究设计示例，不是新增的临床检测适应证。
讨论这个方向
02研究设计延展
治疗前后与残留病灶
治疗后是克隆组成改变，还是细胞状态变化？
- 样本起点
- 治疗前后 FFPE；有新鲜组织时另评估 wellDR-seq。
- 重点分析
- 克隆比例、CNA 事件与治疗时间线的联合比较。
查看验证与设计要点
纳入治疗方案、取材偏差与病理反应；不将结果直接用于个体用药。
03已有乳腺研究基础
早期病变与细胞起源
祖先克隆保留了哪些正常细胞谱系信号？
- 样本起点
- 经评估的新鲜组织；必要时设置正常、癌旁与病变对照。
- 重点分析
- 同细胞 DNA 克隆、RNA 细胞状态与谱系关联线索。
查看验证与设计要点
结合组织定位、标记物与功能实验；起源线索不等于已证明起源。
04基于已发表研究延伸
基因剂量与候选机制
哪些表达程序与特定 CNA 亚克隆相关？
- 样本起点
- 满足同细胞工作流条件的新鲜组织，配合已有研究线索。
- 重点分析
- 亚克隆—表达对应、剂量相关候选与验证优先级。
查看验证与设计要点
遗传干预、蛋白检测和外部队列复核；避免把相关当作因果。
05合作探索方向
克隆与空间微环境
候选克隆位于哪里，周围是什么细胞？
- 样本起点
- 具备区域标注的组织与可衔接的空间数据或相邻切片。
- 重点分析
- 候选克隆区域映射与邻域假设；属于跨数据关联而非默认同细胞。
查看验证与设计要点
克隆特异 CNA、FISH 或适当原位方法验证空间定位。
06合作探索方向
类器官与功能验证
模型保留了哪些克隆，干预后如何变化？
- 样本起点
- 具备匹配原组织的类器官或实验模型，事先评估技术适配。
- 重点分析
- 原组织—模型一致性、克隆选择与候选基因功能实验设计。
查看验证与设计要点
设置独立重复与恰当对照；不把模型药敏等同于患者疗效。
DESIGN EXAMPLE · NOT A COMPLETED CUSTOMER CASE
示例：把“耐药”拆成
可以验证的三个层次。
下述为依据平台能力延展的研究设计，并非已完成客户案例或结果展示。
克隆层
用配对 DNA 数据比较干预前后亚克隆组成，观察选择线索。
状态层
在合适的新鲜样本中，以 wellDR-seq 关联克隆与转录程序。
功能层
在独立模型中验证候选基因，结合空间或病理信息解释环境因素。
LET’S BUILD YOUR STUDY
从一个明确的问题，开始合作。
带上样本类型、研究问题和现有数据，一起判断最合适的起点。