起源与祖先克隆
结合基因组关系与正常上皮谱系信号，提出潜在细胞起源假设，而非直接证明起源。
WELLDR-SEQ · CELL 2025
同一个细胞，
连接克隆与状态。
面向经评估的新鲜组织，联合测量 DNA 与 RNA，为克隆—表型关系提供细胞级证据。
SAME CELL. TWO MOLECULAR READOUTS.
让“表达相似”，
与“遗传同源”分开。
RNA 描述状态，DNA 提供拷贝数与克隆依据。同细胞实测配对，保留二者之间最关键的对应关系。
12研究中的 ER+ 乳腺癌样本
33,646研究分析的单细胞
DNA + RNA同一细胞中的对应读出
以上为 Cell 2025 研究范围，不是多癌种验证或每项目细胞产出的保证。
查看大图 ↗THE PAIRED WORKFLOW
不是多测一个组学，
而是保留一个对应关系。
在 nanowell 工作流中分别标记同一细胞的 DNA 与 RNA，通过细胞条形码保持配对。分析以全基因组范围的低深度 CNA 和转录读出为核心。
DNA
拷贝数结构
基因组亚克隆
RNA
表达程序
细胞状态
PAIR
克隆—表型关系
剂量效应线索
QUESTIONS WORTH GOING DEEPER
哪些问题，值得再加上 DNA？
不是所有转录差异都来自拷贝数改变。先定义亚克隆，再分析各自的表达状态与候选机制。
CNA 与基因剂量效应
在同细胞、同亚克隆框架下比较拷贝数与表达，区分相关关系并选择功能验证候选。
状态变化与治疗研究
在有配对设计与对照的前提下，探索克隆选择和转录可塑性各自的贡献。
SAMPLE & DESIGN NOTES
先确认材料，再安排研究。
适用于什么样本？
本页以已发表的新鲜实体瘤研究为依据。其他保存方式和组织类型须先沟通评估，不默认存档 FFPE 可走该同细胞 DNA+RNA 流程。
已有 scRNA 数据还可以接吗？
可以先讨论如何补充 DNA 证据和验证方案。但旧 scRNA 与新做的 DNA 数据来自不同细胞时，只能按跨样本或跨细胞整合解释，不能宣称已实测 same-cell。
会保证找到稀有克隆或耐药靶点吗？
不会。稀有克隆观察受到有效细胞数、背景、质量与分析阈值影响；机制候选仍需独立验证。项目按明确问题和质量标准推进。
LET’S BUILD YOUR STUDY
从一个明确的问题，开始合作。
带上样本类型、研究问题和现有数据，一起判断最合适的起点。